基因组学AI工具集锦:应用与项目精选

snakePipes:灵活、可扩展的表观基因组分析工具

snakePipes:灵活、可扩展的表观基因组分析工具

snakePipes是一套基于Snakemake和Python构建的自动化工作流程,用于简化和标准化高通量测序数据的分析。它提供了多个常见NGS分析的工作流程,如ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq等,使研究人员能够轻松地执行复杂的分析任务。

SnakePipesNGS数据分析生物信息学工作流Snakemake基因组学Github开源项目
GENA-LM: 一个用于长DNA序列的开源基础模型家族

GENA-LM: 一个用于长DNA序列的开源基础模型家族

GENA-LM是一系列基于Transformer的DNA语言模型,可以处理长达36,000个碱基对的输入序列。这些模型在人类DNA序列上进行了预训练,为复杂的生物学任务提供了强大的基础。

GENA-LMDNA序列预训练模型转化器基因组学Github开源项目
DNA-Diffusion: 使用扩散概率模型生成调控DNA序列

DNA-Diffusion: 使用扩散概率模型生成调控DNA序列

DNA-Diffusion项目利用最新的人工智能扩散模型技术,为DNA调控序列的生成和分析开辟了新方向,有望加速我们对基因调控机制的理解和应用。

DNA Diffusion基因组学人工智能生成模型调控序列Github开源项目
DeepVariant:基于深度学习的高精度变异检测工具

DeepVariant:基于深度学习的高精度变异检测工具

DeepVariant是一款由Google开发的开源变异检测工具,它利用深度神经网络从下一代DNA测序数据中识别遗传变异。该工具具有高准确性、灵活性和易用性,支持多种测序技术和数据类型,是基因组学研究和临床应用的重要工具。

DeepVariantDeepTrio变异检测深度学习基因组学Github开源项目