snakePipes是一套基于Snakemake和Python构建的自动化工作流程,用于简化和标准化高通量测序数据的分析。它提供了多个常见NGS分析的工作流程,如ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq等,使研究人员能够轻松地执行复杂的分析任务。
GENA-LM是一系列基于Transformer的DNA语言模型,可以处理长达36,000个碱基对的输入序列。这些模型在人类DNA序列上进行了预训练,为复杂的生物学任务提供了强大的基础。
DNA-Diffusion项目利用最新的人工智能扩散模型技术,为DNA调控序列的生成和分析开辟了新方向,有望加速我们对基因调控机制的理解和应用。
DeepVariant是一款由Google开发的开源变异检测工具,它利用深度神经网络从下一代DNA测序数据中识别遗传变异。该工具具有高准确性、灵活性和易用性,支持多种测序技术和数据类型,是基因组学研究和临床应用的重要工具。
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