TSDB

TSDB

高效便捷的时间序列数据集加载库

TSDB是一个时间序列数据集加载库,支持172个公开数据集的一键加载。该工具简化了研究人员和工程师的数据获取流程,使他们能专注于数据处理。TSDB具备数据下载、加载和缓存管理功能,并支持缓存目录迁移。作为PyPOTS工具箱的组成部分,TSDB为时间序列数据挖掘提供了基础支持。

TSDB时间序列数据集PyPOTS数据挖掘开源工具Github开源项目

<a href='https://github.com/WenjieDu/TSDB'><img src="https://yellow-cdn.veclightyear.com/835a84d5/b645086a-103f-4f6a-abac-c38dc06c7b37.svg" align='right' width='200'/></a>

<h3 align="center">欢迎使用TSDB</h3>

<p align='center'>只需一行代码即可加载172个公开时间序列数据集 ;-)</p>

<p align='center'> <a href='https://github.com/WenjieDu/TSDB'> <img alt='Python版本' src='https://img.shields.io/badge/python-v3-E97040?logo=python&logoColor=white'> </a> <a href="https://github.com/WenjieDu/TSDB/releases"> <img alt="最新发布版本" src="https://img.shields.io/github/v/release/wenjiedu/tsdb?color=EE781F&include_prereleases&label=Release&logo=github&logoColor=white"> </a> <a href="https://github.com/WenjieDu/TSDB/blob/main/LICENSE"> <img alt="BSD-3许可证" src="https://img.shields.io/badge/License-BSD--3-E9BB41?logo=opensourceinitiative&logoColor=white"> </a> <a href="https://github.com/WenjieDu/PyPOTS/blob/main/README.md#-community"> <img alt="社区" src="https://img.shields.io/badge/join_us-community!-C8A062"> </a> <a href="https://github.com/WenjieDu/TSDB/graphs/contributors"> <img alt="GitHub贡献者" src="https://img.shields.io/github/contributors/wenjiedu/tsdb?color=D8E699&label=Contributors&logo=GitHub"> </a> <a href="https://star-history.com/#wenjiedu/tsdb"> <img alt="GitHub仓库星标" src="https://img.shields.io/github/stars/wenjiedu/tsdb?logo=None&color=6BB392&label=%E2%98%85%20Stars"> </a> <a href="https://github.com/WenjieDu/TSDB/network/members"> <img alt="GitHub仓库分支" src="https://img.shields.io/github/forks/wenjiedu/tsdb?logo=forgejo&logoColor=black&label=Forks"> </a> <a href="https://codeclimate.com/github/WenjieDu/TSDB"> <img alt="Code Climate可维护性" src="https://img.shields.io/codeclimate/maintainability-percentage/WenjieDu/TSDB?color=3C7699&label=Maintainability&logo=codeclimate"> </a> <a href='https://coveralls.io/github/WenjieDu/TSDB'> <img alt='Coveralls报告' src='https://img.shields.io/coverallsCoverage/github/WenjieDu/TSDB?branch=main&logo=coveralls&color=75C1C4&label=Coverage'> </a> <a href='https://github.com/WenjieDu/TSDB/actions/workflows/testing_ci.yml'> <img alt='GitHub测试' src='https://img.shields.io/github/actions/workflow/status/wenjiedu/tsdb/testing_ci.yml?logo=github&color=C8D8E1&label=CI'> </a> <a href="https://arxiv.org/abs/2305.18811"> <img alt="arXiv DOI" src="https://img.shields.io/badge/DOI-10.48550/arXiv.2305.18811-F8F7F0"> </a> <a href="https://anaconda.org/conda-forge/tsdb"> <img alt="Conda下载量" src="https://img.shields.io/endpoint?url=https://pypots.com/figs/downloads_badges/conda_tsdb_downloads.json"> </a> <a href='https://pepy.tech/project/tsdb'> <img alt='PyPI下载量' src='https://img.shields.io/endpoint?url=https://pypots.com/figs/downloads_badges/pypi_tsdb_downloads.json'> </a> </p>

📣 TSDB现在支持总共1️⃣7️⃣2️⃣个时间序列数据集‼️

<a href='https://github.com/WenjieDu/PyPOTS'><img src='https://yellow-cdn.veclightyear.com/835a84d5/d3819451-20ca-42e8-b126-701b25fad9ff.svg' width='160' align='left' /></a> TSDB是 <a href="https://github.com/WenjieDu/PyPOTS"> PyPOTS <img align="center" src="https://img.shields.io/github/stars/WenjieDu/PyPOTS?style=social"> </a> (一个用于部分观测时间序列数据挖掘的Python工具箱)的一部分,为了将数据集与学习算法解耦,它从PyPOTS中分离出来。

TSDB的创建是为了帮助研究人员和工程师摆脱数据收集和下载的烦恼,重新专注于数据处理细节。TSDB为下载和加载开源时间序列数据集提供了一站式的便利(可用数据集列表见下方)。

❗️请注意,由于人们对数据处理的要求各不相同,TSDB中的数据加载函数只包含最基本的步骤(例如删除无效样本),不会对数据进行处理(甚至不会对其进行归一化)。因此,不用担心,TSDB不会影响您的数据预处理。如果您只想要原始数据集,TSDB也可以帮助您下载并保存原始数据集(请查看下方的使用示例)。

🤝 如果您需要TSDB集成一个开源数据集或想自己将其添加到TSDB中,请随时通过创建问题或提交PR来合并您的代码。

🤗 如果您认为TSDB是一个有用的工具包,给这个仓库点个星,帮助其他人注意到TSDB。 如果TSDB对您的研究有帮助,在您的出版物中适当引用TSDB和PyPOTS。 这对我们的开源研究真的意义重大。感谢您!

❖ 使用示例

[!重要] TSDB可在<a alt='PyPI' href='https://pypi.python.org/pypi/tsdb'><img align='center' src='https://img.shields.io/badge/PyPI--lightgreen?style=social&logo=pypi'></a><a alt='Anaconda' href='https://anaconda.org/conda-forge/tsdb'><img align='center' src='https://img.shields.io/badge/Anaconda--lightgreen?style=social&logo=anaconda'></a>上获得❗️

通过pip安装:

pip install tsdb

或从源代码安装:

pip install https://github.com/WenjieDu/TSDB/archive/main.zip

或通过conda安装:

conda install tsdb -c conda-forge

import tsdb # 列出TSDB中所有可用的数据集 tsdb.list() # ['physionet_2012', # 'physionet_2019', # 'electricity_load_diagrams', # 'beijing_multisite_air_quality', # 'italy_air_quality', # 'vessel_ais', # 'electricity_transformer_temperature', # 'pems_traffic', # 'solar_alabama', # 'ucr_uea_ACSF1', # 'ucr_uea_Adiac', # ... # 选择所需的数据集并加载,TSDB 将自动下载、提取和处理 data = tsdb.load('physionet_2012') # 如果需要原始数据,请使用 download_and_extract() tsdb.download_and_extract('physionet_2012', './save_it_here') # 曾经加载过的数据集会被缓存,可以使用 list_cached_data() 查看 tsdb.list_cache() # 可以只删除特定数据集的pickle缓存 tsdb.delete_cache(dataset_name='physionet_2012', only_pickle=True) # 可以只删除特定数据集的原始文件,保留其他文件 tsdb.delete_cache(dataset_name='physionet_2012') # 或者可以使用 delete_cached_data() 删除所有缓存以释放磁盘空间 tsdb.delete_cache() # 默认的缓存目录是用户主目录下的 ~/.pypots/tsdb。 # 为避免在下载多个数据集时占用过多空间, # 可以将 TSDB 缓存目录迁移到外部磁盘 tsdb.migrate_cache("/mnt/external_disk/TSDB_cache")

就是这样。简单高效。尽情使用吧!😃

❖ 可用数据集列表

名称主要任务
PhysioNet Challenge 2012预测、插补、分类
PhysioNet Challenge 2019预测、插补、分类
北京多站点空气质量预测、插补
意大利空气质量预测、插补
电力负荷图预测、插补
电力变压器温度 (ETT)预测、插补
船舶 AIS预测、插补、分类
PeMS 交通预测、插补
阿拉巴马州太阳能预测、插补
UCR 和 UEA 数据集 (全部 163 个数据集)分类

❖ 引用 TSDB/PyPOTS

介绍 PyPOTS 的论文可在 arXiv 上获取, 其简短版本已被第九届 SIGKDD 国际时间序列挖掘与学习研讨会 (MiLeTS'23) 接受。 此外,PyPOTS 已被列入 PyTorch 生态系统 项目。 我们正在争取将其发表在著名的学术期刊上,如 JMLR(机器学习开源软件 专栏)。如果您在工作中使用了 PyPOTS, 请按以下方式引用,并给这个仓库 🌟 加星,让更多人注意到这个库。🤗

有一些科研项目使用了 PyPOTS 并在其论文中引用。 这里是 一个不完整的列表

<p align="center"> <a href="https://github.com/WenjieDu/PyPOTS"> <img src="https://yellow-cdn.veclightyear.com/835a84d5/e20febf2-5b2b-45b3-91e4-02ce842a6052.png" width="95%"/> </a> </p>
@article{du2023pypots, title={{PyPOTS: a Python toolbox for data mining on Partially-Observed Time Series}}, author={Wenjie Du}, journal={arXiv preprint arXiv:2305.18811}, year={2023}, }

Wenjie Du. PyPOTS: a Python toolbox for data mining on Partially-Observed Time Series. arXiv, abs/2305.18811, 2023.

<details> <summary>🏠 访问量</summary> <img align='left' src='https://hits.seeyoufarm.com/api/count/incr/badge.svg?url=https%3A%2F%2Fgithub.com%2FWenjieDu%2FTime_Series_Database&count_bg=%2379C83D&title_bg=%23555555&icon=&icon_color=%23E7E7E7&title=自2022年4月以来的访问量&edge_flat=false'> </details>

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