catch22

catch22

精选时间序列特征提取库

catch22是一个包含22个时间序列特征的开源库,由C语言编写,支持Python、R、Matlab和Julia等多种编程语言。这些特征是从7000多个候选中精选而来,在93个实际时间序列分类问题中表现优异。catch22提供了跨平台的安装方法和使用接口,包括各语言的原生版本和C编译版本。该工具主要用于高效提取时间序列的动态特征,适用于多种研究和应用场景。

catch22时间序列特征数据挖掘机器学习特征提取Github开源项目
<p align="center"><img src="https://yellow-cdn.veclightyear.com/0a4dffa0/87c0e390-fd87-4598-af70-fc4b5b4b307d.png" alt="catch22 标志" height="220"/></p> <h1 align="center"><em>catch22</em>: 规范时间序列特征</h1> <p align="center"> <a href="https://zenodo.org/badge/latestdoi/146194807"><img src="https://yellow-cdn.veclightyear.com/0a4dffa0/d16dff54-d1c4-4b3d-ab2a-daaa59d37aad.svg" height="20"/></a> <a href="https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0"><img src="https://yellow-cdn.veclightyear.com/0a4dffa0/c8455509-890a-49db-9286-513680db9710.svg" height="20"/></a> <a href="https://twitter.com/compTimeSeries"><img src="https://yellow-cdn.veclightyear.com/0a4dffa0/6ba23ab6-23db-4d95-afd1-33afee758887.svg?style=social&label=关注%20%40compTimeSeries" height="20"/></a> </p>

catch22 是一个由22个用C语言编写的时间序列特征组成的集合,可以在Python、R、Matlab和Julia中运行,采用 GNU GPL v3 许可证(或更高版本)。 catch22 特征是 hctsa 中超过7000个特征中表现最佳的子集。

这些特征是基于它们在93个真实世界时间序列分类问题中的分类性能而选择的,详细描述请参阅我们的开放获取论文 📗 Lubba et al. (2019). catch22: 规范时间序列特征

📙📘📗catch22 文档

catch22全面的文档,包括:

  • 安装说明(适用于C、Python、R、Julia和Matlab)
  • 每个特征背后的理论和行为信息
  • 使用或扩展 catch22 的出版物列表
  • 以及更多内容 :yum:

在Python、R、Matlab、Julia和编译C中的安装和使用

其他编程语言也有此代码的原生版本:

你也可以直接使用C编译的特征,或在Matlab中使用,请参考wiki上的详细安装说明

致谢 :+1:

如果您使用此软件,请阅读并引用这篇开放获取文章:

性能摘要

catch22 特征集在93个分类问题上的性能摘要,以及与 hctsa 特征集 的比较(参见我们的论文中的图4):

注意事项

  • 在展示使用 catch22 的结果时,必须标明所使用的版本,以便清晰地复现您的结果。例如,从v0.3版本开始,CO_f1ecac 从整数值输出改为线性插值的实数值输出。
  • catch22 特征仅评估时间序列的动态特性,不响应位置(如均值)或分布(如方差)的基本差异。
  • 如果原始时间序列分布的位置和分布对您的应用很重要,您应该在调用所选语言的 catch22 函数时使用函数参数 catch24 = true(在R中为 TRUE,在Python中为 True)。这将计算24个特征:catch22 特征加上均值和标准差。
  • 时间序列在内部进行 z 分数标准化(除了均值和标准差特征外),这意味着常数时间序列将导致 NaN 输出。
  • 时间序列数据被视为有序值序列(无时间戳)。我们假设时间序列是均匀采样的。
  • 有关特定语言的使用信息,请参见 wiki
  • 用于生成 catch22 特征集的计算流程在 op_importance 仓库中。

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