Cytoscape.js

图论（网络）可视化和分析库：https://js.cytoscape.org

描述

Cytoscape.js 是一个功能齐全的图论库。你需要对关系数据进行建模和/或可视化，比如生物数据或社交网络吗？如果是这样，Cytoscape.js 正是你所需要的。

Cytoscape.js 包含一个图论模型和一个可选的渲染器来显示交互式图形。这个库的设计目的是让程序员和科学家尽可能容易地在他们的应用中使用图论，无论是在 Node.js 应用中进行服务器端分析，还是用于丰富的用户界面。

你可以用一行代码开始使用 Cytoscape.js：

var cy = cytoscape({ elements: myElements, container: myDiv });

通过阅读其文档了解更多关于 Cytoscape.js 的功能。

东京铁路站点网络可以用 Cytoscape 可视化：

东京铁路站点图的在线演示和源代码可供参考。文档中还有更多演示。

你可以在项目网站上找到文档和下载。

Cytoscape.js 的未来版本计划在 Github 问题追踪器的里程碑中。你可以使用里程碑来查看当前为未来版本计划的内容。

你想成为 Cytoscape.js 的贡献者吗？根据你的兴趣，你可以在技术角色（如功能、测试）或非技术角色（如文档、推广）中做出贡献。通过发布 GitHub 讨论与我们联系。

关于提交拉取请求的机制，请参考 CONTRIBUTING.md。

功能版本每月发布一次，而补丁版本每周发布一次。这允许第一方和第三方贡献得到快速发布。

要在论文中引用 Cytoscape.js，请引用牛津生物信息学期刊：

Cytoscape.js：一个用于可视化和分析的图论库 Franz M, Lopes CT, Huck G, Dong Y, Sumer O, Bader GD

安装node和npm。在使用npm run之前运行npm install。

在控制台中运行npm run <target>。主要目标如下：

构建：

build：执行库的所有构建（umd、min、umd、esm）
build:min：执行未压缩的构建，包含捆绑依赖（适用于简单的html页面，适合新手）
build:umd：执行umd（cjs/amd/globals）构建
build:esm：执行esm（ES 2015模块）构建
clean：清理build目录
docs：将文档构建到documentation中
release：构建所有发布工件
watch：自动构建用于调试的库（带有源映射，无babel，非常快）
- 适合在debug/index.html上进行一般测试
- 在http://localhost:8080或之后的第一个可用端口上提供服务，debug/index.html上有实时重载
watch:babel：自动构建用于调试的库（带有源映射，有babel，稍慢）
- 适合测试性能或测试过时的浏览器
- 在http://localhost:8080或之后的第一个可用端口上提供服务，debug/index.html上有实时重载
watch:umd：自动构建生产umd包（无源映射，有babel）
- 适合在另一个项目中测试cytoscape（在项目的package.json中使用"cytoscape": "file:./path/to/cytoscape"引用）
- 无http服务器
dist：更新npm等的分发js

测试：

默认测试脚本直接针对源代码运行。测试也可以在构建的捆绑包上运行。库可以在node>=6上构建，但库的捆绑包可以在node>=0.10上测试。

test：运行所有测试和代码检查
test:js：在库的公共API上运行mocha测试（直接在源文件上）
- npm run test:js -- -g "my test name"仅运行匹配的测试用例
test:build：在库的公共API上运行mocha测试（在构建的捆绑包上）
- 应该在最新版本的node上预先运行npm run build
- npm run test:build -- -g "my test name"仅在匹配的测试用例上运行构建测试
test:modules：在私有、内部API上运行单元测试
- npm run test:modules -- -g "my test name"仅在匹配的测试用例上运行模块测试
lint：通过eslint检查js源代码
benchmark：运行所有基准测试
benchmark:single：仅运行benchmark/single中指定的套件的基准测试