懂AI
spectrum_utils

spectrum_utils

高效处理和可视化质谱数据的Python软件包

spectrum_utils是一个开源的Python软件包，用于处理和可视化质谱数据。它通过USI机制从在线资源加载光谱，提供优化的处理操作，使用ProForma 2.0规范注释光谱片段，并支持生成高质量的自定义光谱图。适用于Python 3.10+版本，可通过pip或conda安装，为质谱数据分析提供了实用的解决方案。

spectrum_utils质谱数据处理Python包数据可视化质谱分析Github开源项目
访问官网GitHub论文文档

spectrum_utils

conda PyPI 构建状态 文档

spectrum_utils 是一个用于高效质谱数据处理和可视化的 Python 包。

spectrum_utils 包含以下功能：

  • 使用通用谱图标识符（USI）机制从在线蛋白质组学和代谢组学数据资源加载谱图。
  • 经过计算效率优化的常见谱图处理操作（前体离子和噪声峰去除、强度过滤、强度缩放）。
  • 使用 ProForma 2.0 规范对（修饰的）肽段形式的观测谱图片段进行注释。
  • 出版质量的、完全可定制的谱图绘制和交互式谱图绘制。

spectrum_utils 标志

安装

spectrum_utils 需要 Python 3.10+ 版本，可以使用 pip 或 conda 进行安装。

使用 pip：

pip install spectrum_utils[iplot]

使用 conda：

conda install -c bioconda spectrum_utils

文档

请查看文档以获取详细的安装说明、使用示例、API 参考和更多信息。

引用

spectrum_utils 作为开源软件在 Apache 2.0 许可下免费提供。

在使用 spectrum_utils 时，请引用以下文章：

  • Wout Bittremieux. "spectrum_utils: A Python package for mass spectrometry data processing and visualization." Analytical Chemistry 92, 659--661 (2020) doi:10.1021/acs.analchem.9b04884。
  • Wout Bittremieux, Lev Levitsky, Matteo Pilz, Timo Sachsenberg, Florian Huber, Mingxun Wang, Pieter C. Dorrestein. "Unified and standardized mass spectrometry data processing in Python using spectrum_utils" Journal of Proteome Research 22, 625--631 (2023) doi:10.1021/acs.jproteome.2c00632。

编辑推荐精选

扣子-AI办公

扣子-AI办公

职场AI，就用扣子

AI办公助手，复杂任务高效处理。办公效率低？扣子空间AI助手支持播客生成、PPT制作、网页开发及报告写作，覆盖科研、商业、舆情等领域的专家Agent 7x24小时响应，生活工作无缝切换，提升50%效率！

堆友

堆友

多风格AI绘画神器

堆友平台由阿里巴巴设计团队创建，作为一款AI驱动的设计工具，专为设计师提供一站式增长服务。功能覆盖海量3D素材、AI绘画、实时渲染以及专业抠图，显著提升设计品质和效率。平台不仅提供工具，还是一个促进创意交流和个人发展的空间，界面友好，适合所有级别的设计师和创意工作者。

图像生成AI工具AI反应堆AI工具箱AI绘画GOAI艺术字堆友相机AI图像热门
码上飞

码上飞

零代码AI应用开发平台

零代码AI应用开发平台，用户只需一句话简单描述需求，AI能自动生成小程序、APP或H5网页应用，无需编写代码。

Vora

Vora

免费创建高清无水印Sora视频

Vora是一个免费创建高清无水印Sora视频的AI工具

Refly.AI

Refly.AI

最适合小白的AI自动化工作流平台

无需编码，轻松生成可复用、可变现的AI自动化工作流

酷表ChatExcel

酷表ChatExcel

大模型驱动的Excel数据处理工具

基于大模型交互的表格处理系统，允许用户通过对话方式完成数据整理和可视化分析。系统采用机器学习算法解析用户指令，自动执行排序、公式计算和数据透视等操作，支持多种文件格式导入导出。数据处理响应速度保持在0.8秒以内，支持超过100万行数据的即时分析。

AI工具酷表ChatExcelAI智能客服AI营销产品使用教程
TRAE编程

TRAE编程

AI辅助编程，代码自动修复

Trae是一种自适应的集成开发环境（IDE），通过自动化和多元协作改变开发流程。利用Trae，团队能够更快速、精确地编写和部署代码，从而提高编程效率和项目交付速度。Trae具备上下文感知和代码自动完成功能，是提升开发效率的理想工具。

AI工具TraeAI IDE协作生产力转型热门
AIWritePaper论文写作

AIWritePaper论文写作

AI论文写作指导平台

AIWritePaper论文写作是一站式AI论文写作辅助工具，简化了选题、文献检索至论文撰写的整个过程。通过简单设定，平台可快速生成高质量论文大纲和全文，配合图表、参考文献等一应俱全，同时提供开题报告和答辩PPT等增值服务，保障数据安全，有效提升写作效率和论文质量。

AI辅助写作AI工具AI论文工具论文写作智能生成大纲数据安全AI助手热门
博思AIPPT

博思AIPPT

AI一键生成PPT，就用博思AIPPT！

博思AIPPT，新一代的AI生成PPT平台，支持智能生成PPT、AI美化PPT、文本&链接生成PPT、导入Word/PDF/Markdown文档生成PPT等，内置海量精美PPT模板，涵盖商务、教育、科技等不同风格，同时针对每个页面提供多种版式，一键自适应切换，完美适配各种办公场景。

AI办公办公工具AI工具博思AIPPTAI生成PPT智能排版海量精品模板AI创作热门
潮际好麦

潮际好麦

AI赋能电商视觉革命，一站式智能商拍平台

潮际好麦深耕服装行业，是国内AI试衣效果最好的软件。使用先进AIGC能力为电商卖家批量提供优质的、低成本的商拍图。合作品牌有Shein、Lazada、安踏、百丽等65个国内外头部品牌，以及国内10万+淘宝、天猫、京东等主流平台的品牌商家，为卖家节省将近85%的出图成本，提升约3倍出图效率，让品牌能够快速上架。

下拉加载更多