clinicadl

<h1 align="center"> <a href="http://www.clinicadl.readthedocs.io"> <img src="https://yellow-cdn.veclightyear.com/ab5030c0/a5ea5360-da30-4f8f-8a3b-7ef6723911c3.png" alt="ClinicaDL标志" width="120" height="120"> </a> <br/> ClinicaDL </h1> <p align="center"><strong>用于使用深度学习方法进行可重复神经影像数据处理的框架</strong></p> <p align="center"> <a href="https://ci.inria.fr/clinicadl/job/AD-DL/job/dev/"> <img src="https://ci.inria.fr/clinicadl/buildStatus/icon?job=AD-DL%2Fdev" alt="构建状态"> </a> <a href="https://badge.fury.io/py/clinicadl"> <img src="https://yellow-cdn.veclightyear.com/ab5030c0/1f901af3-cd39-48c5-80da-9090dd464368.svg" alt="PyPI版本"> </a> <a href='https://clinicadl.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest'> <img src='https://readthedocs.org/projects/clinicadl/badge/?version=latest' alt='文档状态' /> </a> <a href='https://pepy.tech/project/clinicadl'> <img src='https://static.pepy.tech/badge/clinicadl/month' alt='下载量' /> </a> </p> <p align="center"> <a href="https://clinicadl.readthedocs.io/">文档</a> | <a href="https://aramislab.paris.inria.fr/clinicadl/tuto">教程</a> | <a href="https://groups.google.com/forum/#!forum/clinica-user">论坛</a> </p>

关于项目

这个仓库托管了ClinicaDL，它是Clinica的深度学习扩展，Clinica是一个用于处理BIDS格式神经影像数据的Python库。

免责声明： 该软件正在开发中。某些功能可能会在不同版本和/或提交之间发生变化。

要访问项目的完整文档，请访问https://clinicadl.readthedocs.io/。 如果您在使用过程中发现问题或想提供反馈，请提出issue或在论坛上发帖。

入门

ClinicaDL目前支持macOS和Linux。

我们建议使用conda或virtualenv安装ClinicaDL，因为它可以确保正确管理依赖于常见包的库：

conda create --name ClinicaDL python=3.10
conda activate ClinicaDL
pip install clinicadl

教程

访问我们的实践教程网站，直接在Google Colab实例中开始使用ClinicaDL！

相关仓库

• Clinica: 临床神经影像研究软件平台
• AD-DL: 用于阿尔茨海默病分类的卷积神经网络：概述和可重复评估
• AD-ML: 使用机器学习进行阿尔茨海默病可重复分类的框架

引用我们

• Thibeau-Sutre, E., Díaz, M., Hassanaly, R., Routier, A., Dormont, D., Colliot, O., Burgos, N.: 'ClinicaDL: an open-source deep learning software for reproducible neuroimaging processing', 2021. hal-03351976
• Routier, A., Burgos, N., Díaz, M., Bacci, M., Bottani, S., El-Rifai O., Fontanella, S., Gori, P., Guillon, J., Guyot, A., Hassanaly, R., Jacquemont, T., Lu, P., Marcoux, A., Moreau, T., Samper-González, J., Teichmann, M., Thibeau-Sutre, E., Vaillant G., Wen, J., Wild, A., Habert, M.-O., Durrleman, S., and Colliot, O.: 'Clinica: An Open Source Software Platform for Reproducible Clinical Neuroscience Studies', 2021. doi:10.3389/fninf.2021.689675 开放获取版本