PaperRobot

PaperRobot

提高学术研究效率的科学文献草稿生成工具

PaperRobot是一款帮助科研人员生成科学文献草稿的工具。依托大型数据集和机器学习模型,旨在提升学术研究的效率。兼容Python 3.6及Ubuntu系统,并使用Pytorch、NumPy、SciPy及NetworkX等库。提供的PubMed数据集包含标题、摘要和结论等内容的训练、开发和测试数据。用户可通过命令行进行超参数的调整、训练、测试和预测。

PaperRobot科学文献生成Python 3.6PubMed数据集深度学习Github开源项目

PaperRobot项目简介

概述

PaperRobot是一个致力于科学构思稿件增量生成的项目。该项目的研究成果已被第57届计算语言学协会年会(ACL 2019)接受。PaperRobot的目标是通过研究和应用自然语言处理技术,为科学研究文章的草案生成提供支持,提高科学创作的效率和质量。

环境要求

软件环境

  1. Python 版本:3.6

    • 特别提醒:在Python 3.5环境中,模型的保存和加载可能无法正常运行。
  2. 操作系统:Ubuntu 16.04或18.04

    • 注意:因为路径分隔符的差异,模型可能无法在Windows系统上正确运行。

依赖包

  • Pytorch 1.1
  • NumPy 1.16.3
  • SciPy 1.2.1
  • NetworkX 2.3

这些包可通过官网提供的安装指南来配置。

数据集

  1. PubMed Paper Reading Dataset

    • 该数据集包含14,857个实体、133个关系和来自PubMed的分词文本,总共包含875,698个训练对、109,462个开发对和109,462个测试对。
  2. PubMed Term, Abstract, Conclusion, Title Dataset

    • 数据集提供三种类型的对:标题-摘要对、摘要-结论及未来工作对、以及结论和未来工作-标题对。

快速开始

现有论文阅读

为了进行现有论文的阅读和理解,首先需要进行预处理,并从PubMed Paper Reading Dataset中下载并解压缩相应的数据文件。

训练步骤:

  • 调整超参数,例如,要改变隐藏单元数量到6,可以在train.py命令后附加参数--hidden 6
  • 如果需要恢复训练,可以在命令中指定上一个模型的路径。

测试步骤:

  • 在测试模型时,将已完成的模型路径指定于--model参数。通过test.py,可以获取测试集的排名分数。

新论文撰写

对于撰写新论文,同样需要从PubMed Term, Abstract, Conclusion, Title Dataset下载并解压缩数据文件。然后按照如下步骤进行:

训练步骤:

  • 指定数据类型后,例如为训练摘要模型,可以在--data_path后指定相应路径。
  • 同样可以通过指定模型路径来恢复训练。

测试步骤:

  • 指定完成的模型路径,在进行测试时,test.py将提供测试集的分数。

预测实例:

  • 通过input.py,对自定义输入进行预测需要指定模型路径。

引用格式

若引用该项目,可以使用以下格式:

@inproceedings{wang-etal-2019-paperrobot, title = "{P}aper{R}obot: Incremental Draft Generation of Scientific Ideas", author = "Wang, Qingyun and Huang, Lifu and Jiang, Zhiying and Knight, Kevin and Ji, Heng and Bansal, Mohit and Luan, Yi", booktitle = "Proceedings of the 57th Conference of the Association for Computational Linguistics", month = jul, year = "2019", address = "Florence, Italy", publisher = "Association for Computational Linguistics", pages = "1980--1991" }

通过PaperRobot的研究和开发,科学论文的撰写过程可以变得更加结构化、高效,促进科学研究领域的创新与发展。

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