DeepLabCut

DeepLabCut

无标记动物姿态估计工具箱

DeepLabCut是一个无标记动物姿态估计工具箱。此工具适用于各类动物行为的分析,并通过TensorFlow和PyTorch加强模型训练功能。它整合了多种新技术,如MobileNetV2s与EfficientNets,有效提升了效率与准确性。项目提供多语种文档与在线课程,方便用户快速掌握实时多动物追踪及三维姿态估计技术。DeepLabCut已应用于多种场合并获得验证,通过社区持续的优化适用于从神经科学到生态研究的广泛领域。

DeepLabCut动物姿态估计神经科学应用开源工具箱行为追踪Github开源项目

DeepLabCut 项目介绍

什么是DeepLabCut?

DeepLabCut 是一个用于进行无标记姿态估计的开源工具。这个工具箱特别适用于跟踪各种动物在执行不同行为时的姿态,只要你能看到并标记你想要跟踪的目标,就可以使用DeepLabCut。这种通用性使其适用于多种物种和对象,简化了实验室中的行为分析。

安装与入门

要开始使用DeepLabCut,用户需要确保安装了Python 3.10或更高版本。安装非常简单,可以通过以下命令安装有关组件:

pip install "deeplabcut[gui,tf]"

此命令包括所有功能和图形用户界面(GUI)。如果仅需要无GUI版本,可以选择:

pip install deeplabcut[tf]

对于新的PyTorch版本的开发者,还可以通过特定的安装说明来获取。

文档与学习资源

DeepLabCut 提供详细的文档和使用指南,其中包含项目管理工具箱和工作流程的逐步说明。如果您刚接触Python和DeepLabCut,可以通过其提供的在线课程快速上手。相关资源和教程可在DeepLabCut官网上找到,以便用户更深入地了解和熟悉使用方法。

为什么选择DeepLabCut?

DeepLabCut自2018年发布以来,已经被广泛应用于许多不同的研究领域和生物体,包括小鼠、鼠类、人类、鱼类、细菌、机器人、猎豹等。该工具箱依赖于ResNets等最新的特征检测算法,使其能够高效地进行人体姿态估计。此外,DeepLabCut具有快速处理和高性能的特点,支持实时和多动物的姿态估计。

重大版本更新

  • 版本3.0:引入了PyTorch,提升了安装方便性和性能,并提供了更灵活的开发模式。
  • 版本2.3:集成了SuperAnimals模型动物园,改善了用户界面。
  • 版本2.2:添加了多动物姿态估计、识别与跟踪的支持。
  • 版本2.0-2.1:推出了Python版DeepLabCut,增加了数据集创建和行为分析的功能。

活动与新闻

DeepLabCut一直在不断更新和改进,以更好地服务于研究人员和开发者。包括在多个国际会议和学术期刊上发表论文,持续改进算法性能和使用体验,并收到来自Chan Zuckerberg Initiative等机构的资助和认可。

加入DLC社区

为支持和拓展用户社区,DeepLabCut提供了交流和合作的平台,包括社交媒体、GitHub、Image.sc论坛等。用户可以通过这些平台获取帮助、分享经验,或参与到项目的进一步开发中。

参考文献与引用

DeepLabCut作为一个开源工具,欢迎用户在使用时进行引用,具体的引用格式可以在其专门的引用页面中找到。

DeepLabCut不但为研究人员提供了强大的技术支持,也通过其不断的创新和开发,推动了动物行为学和神经科学等多领域研究的进展。

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