陈刘,耶鲁大学计算机科学博士候选人。
研究领域:机器学习、时空建模、医学视觉、AI4Science。
[寻求建议]
[2024年8月2日] 版本4.0发布 >>> 逻辑更新。新增输入参数affiliation_conservative。如果设置为True,我们将使用非常保守的方法来识 别机构,这将导致更高的精确度和更低的召回率。非常感谢刘志坚的有益讨论。
[2024年7月28日] 版本3.10发布 >>> 逻辑更新。在一位有10,000次引用的教授的资料上进行了测试!
[2024年7月27日] 版本2.0发布 >>> 使用多进程实现10倍加速(我的资料从1小时减少到5分钟)。
[2024年7月26日] 版本1.0发布 >>> 首个适用于我的100次引用资料的工作版本。
这是一个简单的Python工具,用于从您的Google Scholar ID生成HTML引用世界地图。
它易于安装(pip install citation-map,可在PyPI上获得)且易于使用(请参阅用户指南)。
除非您想进行自定义更改,否则无需分叉此存储库。
脚本的输出将是一个HTML文件。
如果您在浏览器中打开它,您将看到您自己版本的以下引用世界地图。
<img src = "assets/citation_world_map.png" width=800>此外,还会有一个CSV文件记录引用信息(引用作者、引用论文、被引用论文、机构、详细位置)。
免责声明: 这个工具可能会出现一些小错误:遗漏一些引用作者,在错误位置放置几个标记等。如果您非常在意确保所有引用作者的机构都被包括并准确标记,您可以尝试在Google My Maps上手动注释。这个工具旨在帮助那些无法忍受这个痛苦过程的人,特别是当他们有相当数量的引用时。
注意: 现在您可以使用affiliation_conservative选项在机构精确度和召回率之间进行权衡。如果设置为True,我们将使用Google Scholar验证的引用作者的官方组织名称。这是一种非常保守的方法,因为(1)作者需要在机构面板中自我报告,(2)作者需要用匹配的电子邮件地址进行验证,以及(3)组织需要被Google Scholar记录。例如,Meta(公司)不在列表中。非常感谢刘志坚的有益讨论。
@article{liu2024CitationMap,
title={CitationMap: A Python Tool to Identify and Visualize Your Google Scholar Citations Around the World},
author={Liu, Chen},
journal={TechRxiv},
year={2024}
}
如果您是Python新手,您可能想从一个也帮助管理环境的Python发行版开始(例如anaconda)。一旦您设置好环境(例如,当您在这个教程中达到conda activate env39阶段时),您就可以进入下一步。
通过在conda可访问的命令行中运行以下行来安装此工具。
pip install citation-map --upgrade
找到您的Google Scholar ID。
https://scholar.google.com/citations?user=GOOGLE_SCHOLAR_ID的形式。在这种情况下,您的Google Scholar ID就是字符串GOOGLE_SCHOLAR_ID。&hl=en(主机语言为英语)或&sortby=pubdate(按发布日期排序作品)。在一个空白的Python脚本中,运行以下内容。
citation_map.py,这会导致循环导入,因为这个包本身共享相同的名称。将其命名为其他名称:例如,run_citation_map.py,run.py等。请参见问题#2。if __name__ == '__main__'保护似乎是避免多进程问题所必需的,而且这也是一个好习惯。from citation_map import generate_citation_map
if __name__ == '__main__':
# 这是我的Google Scholar ID。用您的ID替换它。
scholar_id = '3rDjnykAAAAJ'
generate_citation_map(scholar_id)
请注意,在版本4.0中,我们会在识别机构之前缓存结果。因此,如果您想从头重新运行同一作者,您需要删除缓存(默认位置是'cache')。
更多输入参数在演示脚本中显示。
您可以查看generate_citation_map函数的输入参数(列在下面),以防您需要这些功能。
参数
----
scholar_id: str
您的Google Scholar ID。
output_path: str
(默认为'citation_map.html')
输出HTML文件的路径。
csv_output_path: str
(默认为'citation_info.csv')
输出csv文件的路径。
cache_folder: str
(默认为'cache')
保存中间结果的文件夹,在找到(作者,论文)之后但在找到机构之前。
这是因为用户可能想尝试积极vs保守的方法。
如果您不想缓存,请设置为None。
affiliation_conservative: bool
(默认为False)
如果为true,我们将使用更保守的方法来识别机构。
如果为false,我们将使用更积极的方法来识别机构。
num_processes: int
(默认为16)
并行处理的进程数。
use_proxy: bool
(默认为False)
如果为true,我们将使用学术代理。
对于某些环境来说,这是避免被封锁所必需的,但通常会使事情变慢。
pin_colorful: bool
(默认为True)
如果为true,位置标记将有各种颜色。
否则,它将只有一种颜色。
print_citing_affiliations: bool
(默认为True)
如果为true,打印引用机构列表(引用作者的机构)。
这个工具完全基于Google Scholar。因此,您预期会有低估,原因包括:
进行了网页抓取,验证码或机器人检查经常会捕获我们,特别是在我们频繁爬取时。这在被高度引用的用户中更常见。除非您被Google Scholar封锁,最坏的情况下您将遗漏几个引用作者,这对于高度引用的用户来说可能不是大问题。
机构识别和地理定位问题。这是机构识别和地理定位的联合效应。引用机构的数量将会:
geopy.geocoders找到,则被低估。geopy.geocoders发生通信错误,则被低估。geopy.geocoders错误地识别为位置,则被高估。如果您有一些好主意来更好地处理机构字符串,请提出问题或提交拉取请求。请注意,目前我不考虑任何给用户带来额外负担的付费服务或工具,比如GPT API。
MaxTriesExceededException或Exception: 获取Google Scholar页面失败或(对所有条目出现[警告!] 被CAPTCHA或机器人检查阻止)。
scholarly包)而被Google Scholar封锁。num_processes=1)。[警告!] 被CAPTCHA或机器人检查阻止不超过几次,特别是在您有许多引用作者的情况下,这并不是什么大问题。在当前进程完成其引导阶段之前,已尝试启动新进程。
if __name__ == '__main__'保护主函数。您可以再次查看推荐的脚本。from citation_map import generate_citation_map
def main():
# 这是我的Google Scholar ID。请替换成您的ID。
scholar_id = '3rDjnykAAAAJ'
generate_citation_map(scholar_id)
if __name__ == '__main__':
import multiprocessing
multiprocessing.freeze_support()
main()
增加了记录引用信息的额外CSV输 出。
</details> <details> <summary>版本3.10(2024年7月28日)</summary> <br> 在3.10版本中,我略微改进了机构提取的逻辑。在3.8版本中,根据官方文档,我移除了geopy.geocoders的多进程处理。同时清理了一些不必要的scholarly调用,这进一步帮助我们避免被Google Scholar列入黑名单。
在3.7版本中,我更新了网页抓取的逻辑,避免使用scholarly.citeby(),这是触发Google Scholar黑名单的最大原因。
现在我们应该能够比以前处理更多引用的用户。我测试了一个有1000次引用的资料,没有遇到任何问题。
</details> <details> <summary>版本3.0(2024年7月27日)</summary> <br> 我意识到使用`geopy.geocoders`的一个问题。大多数作者的机构包含与机构本身无关的细节。因此,它们在系统中无法成功找到,从而无法在世界地图上转换为地理坐标。例如,我们希望从"Yale University的助理教授"这个字符串中提取"Yale University"这个子串。
我使用一些基于规则的自然语言处理应用了一个简单的修复。这帮助我们识别了许多缺失的引用位置。
如果您有一些好的想法来更好地处理机构字符串,请提出问题或提交拉取请求。请注意,目前我不考虑任何给用户带来额外负担的付费服务或工具,比如GPT API。
</details> <details> <summary>版本2.0(2024年7月27日)</summary> <br> 我终于设法使用多进程处理**大幅加快**了处理速度,同时避免了被Google Scholar封锁。在我的个人电脑上,处理我的100次引用的资料在1.0版本需要1小时,而现在在2.0版本只需5分钟。
话虽如此,请谨慎使用,不要频繁运行此工具。我很容易在运行几次后就被Google Scholar列入黑名单。
</details> <details> <summary>版本1.0(2024年7月26日)</summary> <br> 非常基本的功能。这个脚本有点慢。在我的个人电脑上,处理每个引用需要半分钟。如果您有成千上万的引用,使用这个脚本可能不是一个好主意。
我尝试使用多进程处理,但不幸的是过多的访问让我被Google Scholar封锁了。
</details>依赖项(scholarly、geopy、folium、tqdm、requests、bs4、pycountry、pandas)在通过pip安装时已经被处理。
这个脚本是在ChatGPT-4o的协助下编写的,但当然经过了大量的调试。


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