EEG-ATCNet

EEG-ATCNet

创新深度学习模型提升运动想象分类

EEG-ATCNet是一种创新的深度学习模型,专门用于脑机接口中EEG信号的运动想象分类。该模型融合卷积神经网络、自注意力机制和时间卷积网络,有效提取EEG信号时空特征。在BCI竞赛IV-2a数据集上,EEG-ATCNet准确率达81.10%,优于其他常用模型。项目还实现了多种注意力机制和数据处理方法,为EEG信号分析研究提供了实用工具。

EEGATCNet脑机接口深度学习注意力机制Github开源项目

EEG-ATCNet

PWC

本仓库提供了论文《基于物理信息的注意力时间卷积网络用于脑电图运动想象分类》中提出的注意力时间卷积网络(ATCNet)的代码。

作者:Hamdi Altaheri, Ghulam Muhammad, Mansour Alsulaiman

沙特阿拉伯国王大学智能机器人研究中心

更新

  • ATCNet的正则化参数已经修改,resulting in提高了模型性能并增强了抗过拟合能力。
  • 目前的main_TrainTest.py文件遵循论文1论文2中概述的训练和评估方法,但已被确定为不符合行业最佳实践。因此,我们强烈建议采用在改进的main_TrainValTest.py文件中实现的方法。这个更新版本将数据分为训练/验证/测试集,遵循这篇文章中详细说明的指南(选项2)。

除了提出的ATCNet模型外,models.py文件还包括其他相关方法的实现,这些方法可以与ATCNet进行比较,包括:

下表显示了ATCNet和其他复现模型基于main_TrainValTest.py文件中定义的方法的性能:

<table> <tr> <td rowspan="2">模型</td> <td rowspan="2">参数数量</td> <td colspan="2">BCI 竞赛 IV-2a 数据集 (<a href="https://www.bbci.de/competition/iv/#dataset2a">BCI 4-2a</a>)</td> <td colspan="2">高伽马数据集 (<a href="https://github.com/robintibor/high-gamma-dataset">HGD</a>)<sup>*</sup></td> </tr> <tr> <td>训练时间(分钟)<sup>1,2</sup></td> <td>准确率(%)</td> <td>训练时间(分钟)<sup>1,2</sup></td> <td>准确率(%)</td> </tr> <tr> <td>ATCNet</td> <td>113,732</td> <td>13.5</td> <td>81.10</td> <td>62.6</td> <td>92.05</td> </tr> <tr> <td>TCNet_Fusion</td> <td>17,248</td> <td>8.8</td> <td>69.83</td> <td>65.2</td> <td>89.73</td> </tr> <tr> <td>EEGTCNet</td> <td>4,096</td> <td>7.0</td> <td>65.36</td> <td>36.8</td> <td>87.80</td> </tr> <tr> <td>MBEEG_SENet</td> <td>10,170</td> <td>15.2</td> <td>69.21</td> <td>104.3</td> <td>90.13</td> </tr> <tr> <td>EEGNet</td> <td>2,548</td> <td>6.3</td> <td>68.67</td> <td>36.5</td> <td>88.25</td> </tr> <tr> <td>DeepConvNet</td> <td>553,654</td> <td>7.5</td> <td>42.78</td> <td>43.9</td> <td>87.53</td> </tr> <tr> <td>ShallowConvNet</td> <td>47,364</td> <td>8.2</td> <td>67.48</td> <td>61.8</td> <td>87.00</td> </tr> </table> <sup>1 使用 Nvidia GTX 1080 Ti 12GB</sup><br> <sup>2 (500轮,无提前停止)</sup><br> <sup>* 请注意,<a href="https://github.com/robintibor/high-gamma-dataset">HGD</a>用于"实际运动"而非"运动想象"</sup>

本仓库在attention_models.py文件中包含以下注意力机制的实现:

这些注意力模块可以通过attention_models.py文件中的*attention_block(net, attention_model)方法调用,其中'net'是输入层,'attention_model'*表示注意力机制的类型,有五个选项:None'mha''mhla''cbam''se'

示例:
    input = Input(shape = (10, 100, 1))   
    block1 = Conv2D(1, (1, 10))(input)
    block2 = attention_block(block1,  'mha') # mha: 多头自注意力
    output = Dense(4, activation="softmax")(Flatten()(block2))

preprocess.py文件基于两种方法加载和划分数据集:

  1. 特定受试者(受试者相关)方法。在这种方法中,我们使用与原始BCI-IV-2a竞赛划分相同的训练和测试数据,即第1阶段的试验用于训练,第2阶段的试验用于测试。
  2. 留一受试者法(LOSO)方法。LOSO用于受试者无关评估。在LOSO中,模型通过多个折叠进行训练和评估,折叠数等于受试者数量,每个折叠中使用一个受试者进行评估,其他受试者用于训练。LOSO评估技术确保使用训练数据中未出现的独立受试者来评估模型。

preprocess.py文件中的get_data()方法用于加载数据集并将其分为训练集和测试集。该方法默认使用特定受试者方法。如果您想使用受试者无关(LOSO)方法,请将参数LOSO设置为True

关于ATCNet

ATCNet部分受到Vision Transformer (ViT)的启发。ATCNet与ViT的区别如下:

  • ViT使用单层线性投影,而ATCNet使用多层非线性投影,即专门为基于EEG的脑信号设计的卷积投影。
  • ViT由一系列编码器堆叠而成,前一个编码器的输出是后一个的输入。ATCNet由并行编码器组成,所有编码器的输出被连接起来。
  • ViT中的编码器块由多头自注意力(MHA)和多层感知器(MLP)组成,而ATCNet中MHA后面是时间卷积网络(TCN)。
  • ViT的第一个编码器接收整个输入序列,而ATCNet中每个编码器接收输入序列的移动窗口。

ATCNet与Vit对比

ATCNet模型由三个主要模块组成:

  1. 卷积(CV)模块:通过三个卷积层将MI-EEG信号中的低级时空信息编码为高级时间表示序列。
  2. 注意力(AT)模块:使用多头自注意力(MHA)突出时间序列中最重要的信息。
  3. 时间卷积(TC)模块:使用时间卷积层从突出的信息中提取高级时间特征。
  • ATCNet模型还利用基于卷积的滑动窗口来增强MI数据并有效提升MI分类性能。
<p align="center"> 可视化ATCNet模型中数据的转换。 </p> <p align="center"> <img src="https://yellow-cdn.veclightyear.com/0a4dffa0/07f03058-a6f1-4a59-b29e-cc017bb36379.png" alt="所提出的ATCNet模型的组成部分" width="700"/> </p>

开发环境

模型的训练和测试使用单个GPU,Nvidia GTX 2070 8GB(驱动版本:512.78,CUDA 11.3),使用Python 3.7和TensorFlow框架。在Ubuntu 20.04.4 LTS和Windows 11上使用Anaconda 3。 需要以下软件包:

  • TensorFlow 2.7
  • matplotlib 3.5
  • NumPy 1.20
  • scikit-learn 1.0
  • SciPy 1.7

数据集

需要下载BCI Competition IV-2a数据集,并在main_TrainValTest.py文件中的'data_path'变量中设置数据路径。数据集可以从这里下载。

参考文献

如果您在研究中发现本工作有用,请使用以下BibTeX条目进行引用

[BibTeX引用信息略]

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